蒙牛不斷拓寬產品品類，升級產品營養配方，推出有機、低糖、低鈉、低脂、減少人工成分、解決營養缺乏問題、替代蛋白及小份量產品等多樣化的創新產品。2021年6月，蒙牛發布《蒙牛營養健康政策（2021-2025）》，全面推進營養健康工作。蒙牛與中國農業大學、清華大學、北京大學、中國科學院等16家國內外頂尖高校和研究機構合作，建立世界領先水平的“高科技研究院暨高智能化生產基地”和1座海外研發中心，擁有全球超過30余個研發合作伙伴。2022年，蒙牛持續與中國農業大學、清華大學、中國檢科院等院校開展合作項目，深入蛋白、寡糖、益生菌等營養研究領域，通過技術創新拓展研發成果。

蒙牛聯合中國益生菌產業拓荒人、蒙牛益生菌研究團隊首席專家張和平教授及其團隊，累計穿越超 30,000 公里，奔赴6個省份20多個縣市，共同打造人文生態主題及科研成果紀實類紀錄片《尋菌之路》，展現中國本土益生菌的提取與研發過程，推動提升全民對益生菌及腸道健康的關注。